请注意，具体的应急疫情处理流程可能会根据疫情发展和相关部门的指导进行调整，建议及时关注当地政府和学校的通知和要求。
根据当地政府发布的相关规定，2021杭州富阳区秋季开学后应急疫情处理流程大致如下：
1. 健康监测：学校会要求学生和教职工每天进行健康自查，如测量体温、填写健康健康信息等。
2. 疫情排查：学校会及时跟进学生和教职工的健康状况，如有发热、咳嗽等症状的人员将会被请假、隔离并进行进一步排查。
3. 通知上级部门：学校在发现疫情情况时，会及时上报相关部门，如当地教育局、卫生健康部门等，并按照相关部门的要求进行配合。
4. 隔离措施：对于出现疑似或确诊病例，学校会严格按照卫生健康部门的要求，采取隔离措施，确保患者与他人的有效隔离。
5. 教育教学调整：根据疫情发展情况，学校可能会调整教育教学形式，如采取在线教学、分批上课等方式，以减少人员聚集，确保安全。
6. 宣传教育：学校会加强疫情防控的宣传教育工作，提醒学生和教职工注意个人卫生、佩戴口罩、勤洗手等防控措施的重要性。
7. 深层次消毒：学校会加强对教室、教学设施、公共区域的消毒工作，确保学生和教职工的生活和学习环境的卫生安全。
请注意，具体的应急疫情处理流程可能会根据疫情发展和相关部门的指导进行调整，建议及时关注当地政府和学校的通知和要求。